Microbiologie

BoFU-80: Echografisch geassisteerde MALDI-TOF-identificatie van Rhizopus oryzae

Rhizopus oryzae Komt vaak voor in bodem, lucht en andere stoffen. Het is een belangrijke schimmel bij voedselfermentatie omdat het voedselbederf kan veroorzaken. De kolonie is los of dicht, die aanvankelijk wit is en vervolgens grijsbruin tot zwartbruin wordt. Valse wortels zijn goed ontwikkeld, met vinger- of wortelachtige vertakkingen, en zijn typische draadvormige schimmels die moeilijk te doorbreken zijn. Het eiwit werd geëxtraheerd met behulp van de standaard mierenzuurextractiemethode die werd aanbevolen door Bruker en geïdentificeerd met MALDI-TOF, maar er werd geen duidelijke markerpiek gevonden en deze kon niet worden gedetecteerd. Na gebruik van een reagenskit voor het breken en extraheren van celwanden, werden drie karakteristieke pieken geïdentificeerd, maar er was veel ruis en de massaverhouding (m/z) van de piek was minder dan 200.

De BoFU-80 maakt gebruik van een hoogfrequent gefocusseerd ultrasoon systeem om de akoestische energie in het te verwerken monster te concentreren, wat de eiwitextractiesnelheid van de stam effectief kan verbeteren en de detectiesnelheid van het MALDI-TOF-systeem kan verbeteren. Met behulp van gefocusseerde echografie en reagenskit om eiwit te extraheren voor MALDI-TOF-detectie, werden zes markerpieken verkregen, met een piek-massaverhouding (m/z) groter dan 400 en een score van 9,169 die wijst op een hoge betrouwbaarheid.